如果采用噴霧干燥的方法制取食品，則大部分香料將損失到空氣中，為了防止這種損失，首先要對原料液預處理，可將香料與食用膠、碳水化合物和水混合在一起進行噴霧干燥，則生成粉末狀的微粒膠囊香料，即揮發性香料被包圍在水溶性的固體膠膜內，這防止了香料損失并使香料穩定在膠囊中便于儲存。

又例如，制造陶瓷粉時要求產品具有較窄的粒度分布和顆粒形狀，以便壓型；所以要選擇合適的鹽類以降低泥漿的粘度，提高其固含量，還要在壓形時不會粘在模子中。需要對干燥產品進行后處理以保持合格的產品質量。

如噴霧干燥所得鏈霉素為白色粉末，其溫度常高于40℃，有的制藥廠排出的鏈霉素高達70℃，在這種溫度下立刻包裝，容易變質，顏色發黃，損失藥物的活性而降低產率，低溫噴霧干燥機在這種情況下應采取一定措施，如用滅菌的冷風送以冷卻產品到40℃以下，可以減輕產品的活性損失。

此外，有的需要改變噴霧干燥的操作條件，如料液溫度、壓力、氣固流向，干燥介質的進口溫度的分布情況，防止粘壁的措施等等；有的需要在噴霧干燥器結構上有所改變，如夾套水冷裝置、空氣清掃裝置、機械清掃裝置，這些低溫噴霧干燥機都能滿足。